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CPHI制藥在線 資訊 水庫(kù)細(xì)菌群落分類(lèi)組成與抗生素耐藥功能基因變化過(guò)程研究獲進(jìn)展

水庫(kù)細(xì)菌群落分類(lèi)組成與抗生素耐藥功能基因變化過(guò)程研究獲進(jìn)展

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來(lái)源:中國(guó)科學(xué)院
  2019-07-11
水環(huán)境是抗生素抗性基因重要的儲(chǔ)存庫(kù),自然水體受市政污水、農(nóng)業(yè)徑流等人類(lèi)活動(dòng)影響,可為抗性基因的增殖和傳播提供理想的環(huán)境條件。研究表明,在生活污水、養(yǎng)殖廢水等抗生素含量較高的環(huán)境中,細(xì)菌群落物種分類(lèi)組成變化與抗生素抗性基因動(dòng)態(tài)密切相關(guān)。

       抗生素自發(fā)明以來(lái)被廣泛使用,曾經(jīng)被認(rèn)為是可以治愈任何細(xì)菌感染的靈丹妙藥。然而,由于多種因素的影響,21世紀(jì)以來(lái)細(xì)菌抗生素抗性(耐藥性)問(wèn)題日益突出,導(dǎo)致抗菌藥物治療失效時(shí)有發(fā)生,因此抗生素抗性基因被認(rèn)定為新興污染物。細(xì)菌抗生素抗性雖然是環(huán)境中的自然現(xiàn)象,但隨著環(huán)境中抗生素、重金屬和殺菌劑等濃度升高,對(duì)抗生素抗性基因的選擇壓力增大,促進(jìn)并加速了抗生素抗性基因在環(huán)境中的增殖、擴(kuò)散和傳播;特別是,抗性基因能夠通過(guò)多種途徑轉(zhuǎn)移給致病菌,對(duì)人類(lèi)、環(huán)境和社會(huì)健康構(gòu)成了巨大威脅。水環(huán)境是抗生素抗性基因重要的儲(chǔ)存庫(kù),自然水體受市政污水、農(nóng)業(yè)徑流等人類(lèi)活動(dòng)影響,可為抗性基因的增殖和傳播提供理想的環(huán)境條件。研究表明,在生活污水、養(yǎng)殖廢水等抗生素含量較高的環(huán)境中,細(xì)菌群落物種分類(lèi)組成變化與抗生素抗性基因動(dòng)態(tài)密切相關(guān)。然而,在低抗生素選擇壓力的自然水體中,細(xì)菌群落組成對(duì)抗生素抗性基因動(dòng)態(tài)變化的影響研究較少。此外,目前國(guó)際上對(duì)高頻率時(shí)間尺度上抗生素抗性基因的季節(jié)變化趨勢(shì)與規(guī)律認(rèn)知不足,限制了水體抗生素抗性基因污染風(fēng)險(xiǎn)的精準(zhǔn)、有效防控。

       中國(guó)科學(xué)院城市環(huán)境研究所水生態(tài)健康研究組楊軍團(tuán)隊(duì)建立了城市水庫(kù)高頻觀測(cè)研究站,選取杏林灣水庫(kù)連續(xù)1年每周取樣,采用高通量熒光定量PCR和高通量測(cè)序方法研究了浮游細(xì)菌群落和抗生素抗性基因組成的動(dòng)態(tài)變化過(guò)程,多角度、多層次揭示了細(xì)菌群落組成與抗生素抗性基因的關(guān)系。該研究共檢出197種抗生素抗性基因和10種可移動(dòng)遺傳因子。研究發(fā)現(xiàn),在一周時(shí)間內(nèi),一些細(xì)菌和抗生素抗性基因豐度可發(fā)生劇烈變化或波動(dòng);但在一年時(shí)間尺度上,細(xì)菌群落組成變化具有顯著的季節(jié)性,而抗生素抗性基因組成變化沒(méi)有明顯的季節(jié)性。進(jìn)一步研究表明,盡管細(xì)菌群落與抗性基因具有較弱的相關(guān)關(guān)系,但是細(xì)菌群落組成與抗性基因組成在時(shí)間尺度上變化是不同步的;細(xì)菌群落與環(huán)境因子之間聯(lián)系較抗性基因更緊密,但是中性過(guò)程(隨機(jī)性過(guò)程)對(duì)細(xì)菌群落組成變化影響更大、決定性過(guò)程對(duì)抗性基因組成變化影響更大。此外,研究發(fā)現(xiàn)降雨和濁度與抗性基因豐度和豐富度顯著正相關(guān),而且可移動(dòng)遺傳因子與抗性基因顯著正相關(guān)。總的來(lái)說(shuō),該研究解析了城市水庫(kù)水體中抗生素抗性基因在高頻時(shí)間尺度上的變化模式及影響因素,揭示了低抗生素選擇壓力水體中細(xì)菌群落物種組成與抗性功能的解耦合現(xiàn)象,為水環(huán)境中抗生素抗性基因的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、控制和管理提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

       

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