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液體活檢技術(shù)新突破!AI驗血有望篩查早期肺癌

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來源:新浪醫(yī)藥新聞
  2020-04-01
日前,《自然》雜志發(fā)表了一篇文章,斯坦福大學(xué)的科學(xué)家借助人工智能為液體活檢領(lǐng)域帶來一項重要進展。他們開發(fā)出一種機器學(xué)習(xí)模型,通過分析血液中的DNA突變,可以識別出早期肺癌患者。

       日前,《自然》雜志發(fā)表了一篇文章,斯坦福大學(xué)的科學(xué)家借助人工智能為液體活檢領(lǐng)域帶來一項重要進展。他們開發(fā)出一種機器學(xué)習(xí)模型,通過分析血液中的DNA突變,可以識別出早期肺癌患者。

       肺癌是發(fā)病率和致死率最高的癌癥,每年有200多萬人死于肺癌。雖然隨著臨床診治技術(shù)的提高,肺癌的生存率有所提升。但還有不少患者確診時就是中晚期,大大降低了生存機會。

       目前,肺癌的推薦檢測方法是CT掃描,但做CT不僅昂貴,而且有較高的假陽性率。因此,科研人員轉(zhuǎn)向研究更加精準(zhǔn)而簡單方便的篩查手段,比如通過液體活檢技術(shù)來“驗血測癌”。

       ctDNA檢測是液體活檢技術(shù)其中的一種,通過檢測循環(huán)腫瘤DNA(釋放到血液中的腫瘤DNA片段)就能了解腫瘤細胞內(nèi)的基因突變情況。目前主要方法有:數(shù)字PCR、BEAMing 技術(shù)、標(biāo)記擴增深度測序(TAM-Seq)、癌癥個體化深度測序(CAPP-Seq)。

       然而,癌癥的發(fā)生是一種極為復(fù)雜的、動態(tài)發(fā)展的過程,大部分惡性腫瘤都是在中晚期才被發(fā)現(xiàn)。早期階段血液中的ctDNA還很少,有研究顯示,大多數(shù)I期肺癌患者血液內(nèi)ctDNA水平不到0.1%。

       因此,想要從血液中捕獲到早期癌癥的蛛絲馬跡,就如同在宇宙中探測到來自外太空的微弱信號一樣困難。

       而且,如果血液中的ctDNA數(shù)量不足,液體活檢也不一定能捕捉到這些基因突變,結(jié)果就可能出現(xiàn)假陰性。這些都對ctDNA檢測早期肺癌帶來了巨大的挑戰(zhàn)。

       為把ctDNA檢測應(yīng)用到癌癥早期篩查中,斯坦福大學(xué)的馬克西米利安·戴恩(Maximilian Diehn)和Ash A. Alizadeh教授等人改進了現(xiàn)有的ctDNA檢測技術(shù)。通過癌癥個體化深度測序(CAPP-Seq)來捕獲患者血液樣本中極少量的ctDNA,進而來檢測與非小細胞肺癌相關(guān)的突變。

       首先,在確定肺癌來源的ctDNA與正常細胞釋放的DNA片段突變的差別后,研究團隊開發(fā)了一種名為“Lung-CLiP”的人工智能程序。這套系統(tǒng)把分子測序與機器學(xué)習(xí)整合在一起,訓(xùn)練AI“驗血”。

       研究人員先給模型提供了104例早期非小細胞肺癌患者樣本和56例非癌癥的對照樣本,并且這些對照組在年齡、吸煙史等因素上同屬于肺癌高風(fēng)險人群。

       訓(xùn)練完畢后,研究人員通過另一組由46個早期病例和48例對照的獨立隊列,來驗證Lung-CliP的篩查能力。

       在測試過程中,該系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)了63%的1期肺癌患者腫瘤。結(jié)果雖然不如CT掃描,但可以作為患肺癌高危人群的初步篩查手段。如果患者得到陽性結(jié)果,則建議他們進行更復(fù)雜的檢測。

       研究人員指出,目前基本沒有針對高危患者的篩查,而這種篩查每年可能會延長一千多人的生命,甚至可以用來測試其他癌癥。

       雖然這項檢測還不夠完美,但意味著人們有望識別出處于早期階段的大部分肺癌,未來治愈的幾率也會大大增加。

       很多肺癌患者都是因為確診晚了而加速了死亡進程,但這項利用機器學(xué)習(xí)的新研究為我們提供了一種有前景的早篩方法。期待在經(jīng)過更大規(guī)模的驗證后,人工智能助力的液體活檢技術(shù)可以幫助更多人早期發(fā)現(xiàn)癌癥,挽救更多生命。

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