近年來，人工智能技術的快速發(fā)展，為生命科學領域帶來了新的可能性。深勢科技也在不斷探索AI為藥物設計帶來的變革。5月27日，深勢科技Hermite®夏季發(fā)布會在蘇州圓滿落幕。Hermite®致力于為藥物研發(fā)工作者提供數據、算法、算力三位一體的一站式解決方案，通過提供有價值的計算設計工具，成為藥物研發(fā)工作者的“手”、“眼”、“腦”?，F場，眾多業(yè)內重要專家和代表性企業(yè)齊聚，見證深勢科技新算法成果及新一代藥物計算設計平臺Hermite®新功能的發(fā)布。同時，關于抗體、RNA及合成生物學三大熱門領域的前沿思想，也在這里交匯、碰撞出新的火花。
會上，中國科學院院士、北京科學智能研究院院長鄂維南首先進行開場致辭。鄂維南表示：當前人工智能技術的應用已經成功的滲透到了各個領域。AI for Science作為引領當下科學技術革命的重要驅動力，正在為合成生物學以及抗體和RNA研究等在內的眾多領域帶來新的解決方案。開展這一類的研究，離不開分子模擬實驗預測理論創(chuàng)新等等，這也是人工智能帶來的新的機會所在。
鄂維南指出：AI for Science已經進入了預訓練模型時代，這使得利用大數據和算法的力量對生物大分子進行深度挖掘變得更加可行和高效。通過構建生物網模型能夠為分析生物大分子之間的相互作用、研究RNA的調控等等提供更加有力的支持。AI for Science的底層算法對于優(yōu)化藥物設計、預測藥物的作用，降低藥物研發(fā)成本具有很大的幫助，這也是深勢科技在不斷突破的重點方向之一。今天發(fā)布的 Hermite®生物大分子解決方案就是深勢科技基于[多尺度建模+機器學習+高性能計算]等科學研究的新范式在微觀工業(yè)設計領域推出的新產品。人工智能的技術發(fā)展已經逐步成熟，不過 AI 能為生命科學和生物醫(yī)學做的遠遠不止于此。AI 技術在大分子相關研究中的應用還在不斷完善。AI 模型的準確性和可靠性以及可解釋性還需要進一步的提高，AI 技術和實驗驗證相結合將為藥物研發(fā)持續(xù)提供更為可靠的依據。
隨后，深勢科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰介紹了深勢科技基于AI for Science的新算法。
孫偉杰首先簡單介紹了預訓練模型的原理和應用。在大分子研發(fā)中，序列、結構、動力學這三類預訓練模型都有非常大的開發(fā)空間。他陸續(xù)介紹了深勢科技基于序列的結構和動力學預測、基于序列的蛋白性質預測、基于結構和動力學的蛋白性質預測，以及RNA結構預測等深勢自研的多個性質預測模型，效果遠超此前算法。孫偉杰表示，得益于包括DPA、Uni-Mol、Uni-Fold在內的一系列AI4S預訓練模型的發(fā)展，當前我們在生物醫(yī)藥領域面臨的機遇，就像2018年2019年泛AI領域面臨的機遇一樣，AI4S已進入預訓練模型時代。深勢科技將蓄力打造生物醫(yī)藥的GPT，為行業(yè)研發(fā)提供新起點。選擇Hermite®，就是選擇了強悍的組織保障，也是選擇與AI新時代接軌。
在強大算法體系的支撐下，深勢科技的產品也在不斷迭代、超越。Hermite®是深勢科技近年來在AI for Science領域深耕和集大成的平臺產品，去年10月，深勢科技在上海重磅發(fā)布新一代藥物計算設計平臺Hermite®，如今，Hermite®迎來了全新升級。
基于深勢科技AI for Science新算法，公司藥物設計平臺產品負責人徐濤博士發(fā)布了Hermite®產品新功能。對于大分子研發(fā)領域，Hermite®新增生物大分子整體解決方案，實現了從序列分析到結構預測，結構預測到功能分析，及基于功能分析后的生物大分子設計的全流程功能。
在可視化方面，Hermite® 體驗全新升級，新增的分子展示體驗能夠幫助藥物研發(fā)科學家更好地展現、查看、構建和優(yōu)化預測結果的2D和3D結構。
在小分子藥物研發(fā)領域， 基于深勢科技最新算法成果，Hermite®上線了Uni-QSAR，一個集合預訓練模型的、多維度表征分子的、多模型自動集成的功能?；赨ni-Mol預訓練模型，Uni-QSAR 不僅有效解決了傳統(tǒng)QSAR領域中：有標簽數據“稀缺”、分子表征能力低、手動調參、模型單一等挑戰(zhàn)，其多模型集成的高效并行流程及資源調度模型，更極大降低了建模的成本，提高了建模的速度，在諸如分子性質預測等任務的標準測試下，結果達到SOTA[1]。此外，Hermite®也進一步優(yōu)化和豐富了其核心功能Uni-FEP，Uni-Aquasite的實際應用場景，提升了穩(wěn)定性和準確性的同時，大幅提高平臺操作友好性和便捷性。
圍繞近期熱門領域，大會還開展了生物藥創(chuàng)新論壇、RNA前沿論壇、合成生物學論壇等三場別開生面的討論，十余位嘉賓進行了深入交流、探討。在上海交通大學藥學院院長張翱的主持下，晶泰科技聯合創(chuàng)始人&CEO馬健、火山引擎醫(yī)療健康行業(yè)解決方案總監(jiān)楊旭東、沙礫生物創(chuàng)始人&首席執(zhí)行官劉雅容、華為云中國區(qū)生物醫(yī)藥行業(yè)總經理樸雪花、諾納生物CTO何云圍繞生物藥創(chuàng)新展開了討論。圍繞RNA前沿話題，楷拓生物聯合創(chuàng)始人&CEO王瀟、礪博生物創(chuàng)始人&CEO詹劍、思合基因聯合創(chuàng)始人黨云琨、維亞生物高級副總裁蔡建華、艾博生物計算生物負責人陳榮華、竣蒞醫(yī)藥創(chuàng)始人&CEO徐軍、深勢科技大分子研發(fā)負責人溫翰進行了深入交流。在合成生物學論壇中，芯宿科技聯合創(chuàng)始人&CSO董一名、麗合智造首席算法科學家邢華東、聚維元創(chuàng)聯合創(chuàng)始人&CTO李承、斯道資本資深投資經理王博分享了各自觀點。
新藥研發(fā)長期背負著三座大山：高風險、高投入、長周期。近年來，行業(yè)痛點愈發(fā)顯現、尋求突破愈發(fā)困難，藥物研發(fā)工作者也亟需升級自己的“武器庫”。深勢科技基于AI for Science新范式，創(chuàng)新成果頻出，未來也將在“持續(xù)創(chuàng)新，成就伙伴”的理念下，將Hermite®打造為新一代臨床前藥物設計綜合整體解決方案。
參考文獻
[1] Gao, Zhifeng, et al. "Uni-QSAR: an Auto-ML Tool for Molecular Property Prediction." arXiv preprint arXiv:2304.12239 (2023).
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深勢科技致力于運用人工智能和分子模擬算法，結合先進計算手段求解重要科學問題，為人類文明最基礎的生物醫(yī)藥、能源、材料和信息科學與工程研究打造新一代微尺度工業(yè)設計和仿真平臺。
我們開創(chuàng)性地提出了「多尺度建模+機器學習+高性能計算」的革命性科學研究新范式，并推出了Bohrium®微尺度科學計算云平臺、Hermite®藥物計算設計平臺、RiDYMO®強化動力學平臺及電池材料計算設計平臺等微尺度工業(yè)設計基礎設施，顛覆了現有研發(fā)模式，打造“計算引導實驗、實驗優(yōu)化設計”的全新范式。
深勢科技是國家高新技術企業(yè)、北京市“專精特新”中小企業(yè)，總部位于北京，并在上海、深圳等城市布局研發(fā)中心。科研技術團隊由中國科學院院士領銜，匯集了超百位數學、物理、化學、生物、材料、計算機等多個領域的優(yōu)秀青年科學家和工程師，其中公司的博士及博士后占比超過35%。核心成員獲得過2020年全球計算機高性能計算領域的最高獎項“戈登貝爾獎”，相關工作當選2020年中國十大科技進展和全球AI領域十大技術突破。
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