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CPHI制藥在線 資訊 癌癥中的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化:從機制到藥物靶點

癌癥中的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化:從機制到藥物靶點

來源:小藥說藥
  2024-03-13
蛋白質(zhì)脂質(zhì)化是一類不同的翻譯后修飾(PTM),由40多種酶調(diào)節(jié),靶向3000多個位點的1000多種底物。脂質(zhì)蛋白包括150多種癌蛋白,涉及癌癥起始、進展和免疫的介質(zhì)、受體激酶、轉(zhuǎn)錄因子、G蛋白偶聯(lián)受體和細(xì)胞外信號蛋白。脂質(zhì)化調(diào)節(jié)其蛋白質(zhì)底物與細(xì)胞膜的物理相互作用,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)信號傳導(dǎo)和運輸,并在代謝和免疫中發(fā)揮關(guān)鍵作用。

       蛋白質(zhì)脂質(zhì)化是一類不同的翻譯后修飾(PTM),由40多種酶調(diào)節(jié),靶向3000多個位點的1000多種底物。脂質(zhì)蛋白包括150多種癌蛋白,涉及癌癥起始、進展和免疫的介質(zhì)、受體激酶、轉(zhuǎn)錄因子、G蛋白偶聯(lián)受體和細(xì)胞外信號蛋白。脂質(zhì)化調(diào)節(jié)其蛋白質(zhì)底物與細(xì)胞膜的物理相互作用,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)信號傳導(dǎo)和運輸,并在代謝和免疫中發(fā)揮關(guān)鍵作用。

       蛋白質(zhì)脂質(zhì)化可大致分為兩種類型:組成型脂質(zhì)化,其中脂質(zhì)作為蛋白質(zhì)合成或成熟的組成部分附著;以及動態(tài)脂質(zhì)化,例如在信號級聯(lián)過程中,從成熟蛋白質(zhì)中動態(tài)添加或去除脂質(zhì)。對復(fù)雜和動態(tài)的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化景觀進行分析具有相當(dāng)大的挑戰(zhàn),癌癥中的脂質(zhì)PTM及其失調(diào)為癌癥藥物發(fā)現(xiàn)提供了目前尚未開發(fā)的潛在靶點來源。因此,我們需要加強對癌癥靶向蛋白脂質(zhì)化途徑的理解,推動靶向蛋白脂質(zhì)化癌癥藥物的臨床研究,提供靶向蛋白質(zhì)脂質(zhì)化的新型腫瘤療法。

       癌癥中的S-丙烯酰化

       S-丙烯?;诘鞍踪|(zhì)合成后迅速發(fā)生,并且是不可逆的,在蛋白質(zhì)的一生中持續(xù)存在。這一過程是由四種蛋白質(zhì)丙炔基轉(zhuǎn)移酶,法尼基轉(zhuǎn)移酶(FTase)和香葉基-香葉基轉(zhuǎn)移酶I、II和III(GGTase I–III),在C末端或附近的半胱氨酸殘基上添加類異戊二烯脂質(zhì)引發(fā)的。

癌癥中的S-丙烯?;? src=

       最突出的丙酰化癌蛋白是四種RAS亞型(KRAS4A、KRAS4B、NRAS和HRAS),約占19%的突變癌癥患者,尤其是那些對治療最 具耐藥性的患者。有證據(jù)表明,在健康人和疾病患者中,異戊二烯化參與了這些癌蛋白的調(diào)節(jié)。RAS激活突變普遍保留了膜定位和致癌信號傳導(dǎo)所需的CaaX盒預(yù)酰化位點,以及KRAS4A、NRAS和HRAS的二次棕櫚?;璧奈稽c。異丙基半胱氨酸羧甲基轉(zhuǎn)移酶(ICMT)對丙?;揎椀倪M一步處理影響RAS蛋白定位和RAS-驅(qū)動的惡性轉(zhuǎn)化。最近的研究表明,ICMT還可能有助于癌癥細(xì)胞增殖和存活、DNA損傷修復(fù)、干性和自我更新。

       通過靶向脂質(zhì)化破壞RAS定位和下游信號傳導(dǎo)已被廣泛研究作為靶向RAS突變體的一種方法。2020年,F(xiàn)Tase抑制劑(FTI) lonafarnib成為首 個獲批的抗蛋白質(zhì)-脂質(zhì)轉(zhuǎn)移酶的藥物,靶向罕見病早衰亞型中層粘連蛋白a法尼?;漠惓1A?。此外,F(xiàn)TI tipifarnib已被授予針對攜帶HRAS突變的HNSCC的突破性療法。不幸的是,由于劑量限制、靶向血液毒性和耐藥性,II期臨床試驗中最初表現(xiàn)出的高反應(yīng)率很短暫。為了降低耐藥性,目前正在研究聯(lián)合療法。此外,一種GGTase I抑制劑(GGTI-2418,也稱為PTX-100)已進入T細(xì)胞淋巴瘤(NCT03900442)的Ib期臨床試驗。

       癌癥中N-肉豆蔻?;?/strong>

       N-肉豆蔻?;且环N不可逆的C14:0脂質(zhì)PTM,由N-肉豆蔻基轉(zhuǎn)移酶(NMT)催化,從肉豆蔻基CoA(Myr-CoA)轉(zhuǎn)移到人類蛋白質(zhì)組中200多種底物蛋白的N-末端甘氨酸。肉豆蔻?;梢越閷?dǎo)動態(tài)膜結(jié)合,觸發(fā)次級PTM(如S-?;┖偷鞍踪|(zhì)相互作用,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)復(fù)合物的酶活性,或變構(gòu)調(diào)節(jié)可溶性蛋白質(zhì)。

癌癥中N-肉豆蔻?;? src=

       SRC家族激酶是NMT的首批鑒定底物之一,隨后的研究表明,NMT通過多種致癌途徑調(diào)節(jié)底物。例如,肉豆蔻?;瘜⒚撹F抑制蛋白1(FSP1)靶向膜,在膜中它防止氧化脂質(zhì)物質(zhì)的積累。NMT底物包括傳統(tǒng)方法無法治療的致癌蛋白家族,包括ADP核糖基化因子蛋白(ARFs)、ARF樣蛋白(ARLs)和高爾基體重組堆疊蛋白(GOASP),它們調(diào)節(jié)ER–高爾基體運輸,參與線粒體復(fù)合體I組裝等。

       asciminib是一種口服給藥的小分子選擇性變構(gòu)抑制劑,靶向BCR-ABL1酪氨酸激酶的肉豆蔻??诖芍Z華制藥研發(fā),主要用于費城染色體陽性(Ph+)慢性粒細(xì)胞白血?。–ML)。于2021年獲得FDA批準(zhǔn),在激酶抑制劑耐藥性癌癥中顯示出療效,并在臨床試驗中顯示出持久的反應(yīng)(NCT02081378,NCT03106779)。

       NMT活性也可以直接靶向,為對抗多種其他不可治療的癌蛋白提供了一個獨特的干預(yù)點,這些癌蛋白匯聚在調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成的途徑上。來自幾項體外和體內(nèi)研究的證據(jù),包括膀胱癌和B細(xì)胞淋巴瘤的異種移植物模型,以及肺癌的同基因小鼠模型中,抑制NMT通過LAMTOR1的功能喪失誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞中的蛋白質(zhì)合成阻斷。

       最后,NMT抑制劑偶聯(lián)的抗體偶聯(lián)藥物(ADC)顯示出顯著的提高療效和耐受性的潛力,最近在乳腺癌、胃癌和前列腺癌的異種移植物模型中報道了腫瘤的完全消退。這些數(shù)據(jù)表明,NMT抑制劑的靶向遞送可能擴大靶向癌癥范圍。

       癌癥中的S-棕櫚?;?/strong>

       在人類中,S-棕櫚酰化由ZDHHC家族中的23種蛋白質(zhì)催化,其去除可由絲氨酸水解酶超家族的多種APT催化,包括APT1、APT2和含有α/β水解酶結(jié)構(gòu)域(ABHD)的蛋白質(zhì)ABHD17A、ABHD17B、ABHD17 C和ABHD10,使S-棕櫚?;蔀橐活惇毺氐目赡婧蛣討B(tài)的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化。

癌癥中的S-棕櫚?;? src=

       在超過100項蛋白質(zhì)組學(xué)和生物化學(xué)研究中,超過2400種哺乳動物蛋白質(zhì)發(fā)生棕櫚酰化。這些蛋白質(zhì)包括整合膜蛋白、外周膜蛋白、細(xì)胞質(zhì)信號蛋白和轉(zhuǎn)錄因子。包括NRAS、KRAS4A、HRAS、EGFR和p53在內(nèi)的癌蛋白依賴于S-棕櫚?;h(huán)來調(diào)節(jié)其定位、活性或相互作用因子,已知大于150種癌蛋白是S-棕櫚酰酸化的。

       棕櫚?;侵掳┘っ傅闹匾{(diào)節(jié)因子,包括肝細(xì)胞 生長因子受體酪氨酸激酶MET,其中ER中的棕櫚?;瘜\輸、穩(wěn)定性和表達是很重要的。此外,有證據(jù)表明,EGFR信號傳導(dǎo)對其棕櫚?;写龠M和抑制作用,這可能是由于存在多個棕櫚?;稽c,這些位點由不同的ZDHHC蛋白調(diào)節(jié),并具有不同的功能效應(yīng)。棕櫚?;€調(diào)節(jié)G蛋白偶聯(lián)受體的活性,包括黑素皮質(zhì)素-1受體(MC1R)的活性,后者在紫外線照射后驅(qū)動黑色素的產(chǎn)生和DNA修復(fù)。因此,棕櫚?;軗p的MC1R會增加黑色素瘤的風(fēng)險。

       S-棕櫚酰化與癌癥治療的耐藥性也有關(guān)。例如,ZDHHC2介導(dǎo)的線粒體酰甘油激酶(AGK)的棕櫚?;ㄟ^激活A(yù)KT–mTOR信號增加腎細(xì)胞癌中舒尼替尼的耐藥性,而ZDHHC16介導(dǎo)的PCSK9的棕櫚?;ㄟ^激活PI3K–AKT途徑誘導(dǎo)癌癥中索拉非尼的耐藥性。

       轉(zhuǎn)錄增強相關(guān)結(jié)構(gòu)域(TEAD)蛋白在Hippo信號傳導(dǎo)下游調(diào)節(jié)細(xì)胞生長和增殖。GNE-7883是最近報道的一種優(yōu)化的TEAD棕櫚酰化抑制劑,它強烈抑制YAP/TAZ與所有四個TEAD家族成員(TEAD1–4)的結(jié)合,并在NSCLC的患者衍生異種移植物模型中逆轉(zhuǎn)Hippo驅(qū)動的對KRAS-G12C抑制劑的內(nèi)在和獲得性耐藥。第一批進入間皮瘤I期臨床試驗的TEAD自棕櫚?;种苿╋@示出良好的耐受性和抗腫瘤活性(NCT05228015和NCT04665206)。

       小結(jié)

       調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)脂質(zhì)化為我們提供一種獨特的方法,通過控制其膜結(jié)合、運輸、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,靶向其他難以治療的癌蛋白。隨著我們對癌癥中蛋白質(zhì)脂質(zhì)化相關(guān)性認(rèn)識的發(fā)展,新的治療機會可能會出現(xiàn)。

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