利用合成致死(Synthetic Lethality)特異性殺傷腫瘤細胞,是近年來腫瘤臨床治療的一項重要嘗試。特別是靶向 BRCA1/BRCA2 突變的 PARP 抑制劑(PARPi),自問世以來便展現(xiàn)出顯著的臨床療效,為基于合成致死原理的靶向藥物開發(fā)提供了積極的實踐驗證。
然而,PARPi 的應用有其局限性,即便在 BRCA1/2 突變的腫瘤細胞中,也并非所有病例均能對其產(chǎn)生敏感應答。究其原因,除了耐藥機制的存在,還在于 BRCA1/2 所參與的生物學過程比以前學術界所知的更為復雜。近年來,BRCA1/2 被發(fā)現(xiàn)在復制叉穩(wěn)定性維持中發(fā)揮關鍵作用,然而細胞進行復制叉穩(wěn)定性維持的分子機制還未得到清晰揭示。
2025年1月14日18時,浙江大學劉婷教授團隊、方東教授團隊及黃俊教授團隊(博士生謝海華、宋禮志為共同第一作者)合作,在 Nature 子刊 Nature Chemical Biology 上發(fā)表了題為:Synergistic protection of nascent DNA at stalled forks by MSANTD4 and BRCA1/2-RAD51 的研究論文。該研究揭示了一條與 BRCA1/2 合成致死的新通路。
在這項最新研究中,研究團隊發(fā)現(xiàn)了一個具有與端粒結合蛋白 TRF1/TRF2 類似的 Myb/SANT-like DNA 結合結構域的新蛋白——MSANTD4(Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4),能結合于停滯復制叉翻轉臂的 3'-ssDNA 末端,特異性阻礙 RPA-WRN/BLM-DNA2 復合物對翻轉臂上新生 DNA 的過度切割,從而維持停滯復制叉的穩(wěn)定性。該通路完全獨立于傳統(tǒng)已知的由 BRCA1/2-RAD51 介導的停滯復制叉保護機制,因此與 BRCA1/2 合成致死。
該研究首次報道了 MSANTD4 在復制叉穩(wěn)定性維持中的功能及分子機制,為深入理解復制叉穩(wěn)定性維持的分子機制以及腫瘤治療提供了全新視角。
在高等真核生物中,復制叉翻轉(Fork reversal) 是細胞應對復制壓力的一種進化上高度保守的機制。在此過程中,“三叉”結構的復制叉在轉位酶(例如 SMARCAL1、ZRANB3、HLTF 和 PICH),以及 DNA 拓撲異構酶 TOP2A 和 SUMO E3 連接酶 ZATT 等因子的協(xié)作下,被重塑為更穩(wěn)定的“四叉”結構,從而維持復制叉的動態(tài)平衡。然而,復制叉翻轉臂末端由于其結構類似于單一末端的 DNA 雙鏈斷裂(One-ended DSB),極易受到核酸酶攻擊,從而引發(fā)新生DNA鏈的降解,導致基因組不穩(wěn)定性。
已有研究表明,BRCA1/2 介導的 RAD51-DNA 核纖絲(RAD51 filament) 能夠保護停滯復制叉的翻轉臂,起到維持復制叉穩(wěn)定性的作用。然而,現(xiàn)有證據(jù)顯示,BRCA1/2-RAD51 軸并不能完全抵御多種核酸酶的攻擊,這表明可能存在獨立于 BRCA1/2-RAD51 的其它保護機制,有待進一步研究和揭示。
在解旋酶 WRN/BLM 等的協(xié)助下,核酸酶 DNA2 可修剪翻轉復制叉的末端,產(chǎn)生帶有 3'-單鏈DNA突出末端(3'-overhanged DNA)的結構。這一結構是復制壓力緩解后,復制叉通過同源重組(Homologous recombination,HR)實現(xiàn)重啟的關鍵。然而,若這一切割過程失控,將導致復制叉的降解,并顯著增加基因組不穩(wěn)定性的風險。因此,如何精確調(diào)控這些復合物的活性,成為實現(xiàn)停滯復制叉精準調(diào)控和有效保護的關鍵科學問題。
研究團隊發(fā)現(xiàn),MSANTD4 蛋白在復制壓力下能夠被招募至停滯復制叉,并特異性結合 3'-overhanged DNA。該蛋白通過拮抗 BLM 或 WRN 對復制叉翻轉臂雙鏈 DNA 的解旋活性,有效阻止了 DNA2 對新生 DNA 的降解。與這一作用一致,MSANTD4 的缺失會導致細胞內(nèi)新生 DNA 降解顯著增加,同時提升細胞對復制壓力的敏感性。此外,由于 MSANTD4 保護翻轉復制叉末端的機制與傳統(tǒng)的 BRCA1/2-RAD51 軸完全不同,研究者還發(fā)現(xiàn),MSANTD4 的缺陷能夠進一步加劇 BRCA 缺陷細胞中新生 DNA 的降解現(xiàn)象,并顯著提高這些細胞對復制壓力的敏感性,展現(xiàn)出“合成致死”的效應。
綜上所述,該研究首次報道了 MSANTD4 在復制叉穩(wěn)定性調(diào)控中的關鍵功能與作用機制;系統(tǒng)闡明了 MSANTD4 保護停滯復制叉新生 DNA 鏈的分子生物學過程;同時揭示了一種 MSANTD4 與 BRCA1/2-RAD51 協(xié)作的新型復制叉保護模式。該協(xié)同機制能夠有效防止核酸酶對停滯復制叉翻轉臂中新生 DNA 的過度降解,為 BRCA1/2 突變相關腫瘤的“合成致死”療法開發(fā)提供了潛在的全新靶點。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41589-024-01833-9
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