在細胞這個精密運轉的“微型城市”中,信使RNA(mRNA)分子如同快遞包裹,承載著生命活動的核心指令,將來自DNA的遺傳信息通過核糖體翻譯為蛋白質,以執(zhí)行生命活動。
N6-甲基腺苷(m6A)是mRNA中最常見的化學修飾,其在特定的mRNA中富集,并發(fā)揮著調節(jié)細胞生長、分化和細胞應激反應的重要作用,m6A是由包含METTL3和METTL14的異二聚體甲基轉移酶在 mRNA 上合成的m6A的主要作用是促進mRNA的降解,因此,攜帶m6A 的mRNA通常維持在較低水平,而這些mRNA中的許多編碼關鍵細胞過程的重要調控因子,其上調對于激活各種細胞反應是必需的。
細胞應激反應依賴于由m6A-mRNA編碼的蛋白質。例如,氨基酸耗竭壓力會改變基因表達,以增強資源的保存、恢復營養(yǎng)水平以及提高抗壓能力。這些通路通常利用富含m6A的mRNA,這些mRNA編碼代謝調控因子、DNA修復通路蛋白和自噬蛋白。盡管已發(fā)現(xiàn)某些mRNA的水平在應激期間有所上升,但尚不清楚這些上升是否是由于抑制了m6A介導的mRNA降解所致。
2025年5月5日,康奈爾大學的研究人員在國際頂尖學術期刊Cell上發(fā)表了題為:m6Aalters ribosome dynamics to initiate mRNA degradation的研究論文。
該研究首次揭示了m6A 通過引發(fā)核糖體停滯和碰撞來啟動 mRNA 降解的全新機制,為癌癥治療和抗衰老研究打開了新思路。具體來說,m6A 會強效誘導核糖體停滯,進而導致核糖體碰撞,m6A 位點的核糖體停滯和碰撞會招募 YTHDF 蛋白來促進 mRNA 降解。該研究還發(fā)現(xiàn),當細胞處于壓力應激狀態(tài)(例如氨基酸缺乏)時,這種 m6A 介導的 mRNA 降解過程會被暫停,從而允許應激反應mRNA的積累并產(chǎn)生幫助細胞恢復的蛋白質。
總的來說,這項研究表明,核糖體的作用不僅僅是讀取 mRNA 信息來合成蛋白質,還會在 mRNA 中搜尋m6A 修飾,作為啟動m6A-mRNA 靶向降解的傳感器。
m6A:mRNA的“定時 炸彈”
m6A 是 mRNA 上最常見的化學修飾,如同在快遞包裹上蓋下的“限時銷毀”印章。傳統(tǒng)認知中,m6A 修飾通過招募 YTHDF 蛋白復合體直接降解 mRNA。
而這項最新研究顛覆了傳統(tǒng)認知:m6A 真正的殺傷力,源于它對蛋白質合成機器——核糖體的精準干擾。
研究團隊發(fā)現(xiàn),攜帶m6A修飾的 mRNA 會讓核糖體在特定密碼子前停滯 0.5 秒以上,比普通密碼子停滯時間長 3 倍。停滯的核糖體會引發(fā)后續(xù)核糖體碰撞,形成獨特的“雙核糖體足跡”,這些核糖體碰撞導致mRNA 降解效率提升高達70%。也就是說,m6A修飾導致核糖體在讀取 mRNA 時發(fā)生“急剎車”,從而導致“連環(huán)追尾”,進而加速了mRNA 的降解。
YTHDF 的智能響應
該研究進一步揭示,碰撞的核糖體會在“事故現(xiàn)場”形成特殊結構界面,吸引 YTHDF 蛋白前來處理:
精準定位:YTHDF 與碰撞核糖體的結合強度比普通m6A位點高 2.3 倍;
協(xié)同作用:核糖體碰撞使 YTHDF 對 3'UTR 區(qū)域的m6A 識別效率提升 40%;
動態(tài)調節(jié):當細胞遭遇氨基酸缺乏等應激壓力時,全局翻譯減速使 m6A-mRNA 半衰期延長 3-5 倍。
該研究的核心發(fā)現(xiàn):
• m6A-mRNA 的降解是一個翻譯依賴的過程;
• m6A 是一種強大的核糖體停滯誘導劑,會進一步導致核糖體碰撞;
• m6A 位點的核糖體碰撞可通過招募 YTHDF 以促進 mRNA 降解;
• 細胞壓力應激期間的翻譯抑制穩(wěn)定了m6A-mRNA 以應對應激反應。
這種機制使得細胞能快速調整基因表達譜,在營養(yǎng)充足時清理掉非必需基因的 mRNA,而在應激壓力下保留自噬、DNA 修復等關鍵生存基因的 mRNA,優(yōu)先保障生存。
疾病治療的潛在新靶點
該發(fā)現(xiàn)為癌癥治療以及抗衰老治療提供了全新視角:
1、化療增敏:抑制 ASCC3 解旋酶可延長核糖體碰撞,增強m6A-mRNA 降解,或能幫助清除癌細胞的促生存基因;
2、代謝調控:營養(yǎng)應激時m6A 調控的基因網(wǎng)絡與腫瘤微環(huán)境適應密切相關;
3、神經(jīng)保護:阿爾茨海默病患者腦組織中已發(fā)現(xiàn)異常的m6A 積累,調控該通路可能延緩神經(jīng)退化。
總的來說,這項研究架起了表觀遺傳修飾與翻譯調控的橋梁,為理解細胞如何動態(tài)調控基因表達提供了全新范式。從“分子標簽”到“交通調度”,m6A 調控機制的層層揭秘,再次印證了生命系統(tǒng)的精妙設計。這項基礎研究的突破,或將催生新一代 RNA 靶向藥物的誕生。
論文鏈接:https://www.cell.com/med/fulltext/S2666-6340(25)00119-9
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