以連接組和空間轉(zhuǎn)錄組為代表的多組學研究已進入單細胞分辨率時代，這需要具備單細胞水平空間定位能力的參考腦圖譜。然而，現(xiàn)有的腦圖譜都沒能做到單細胞可見的空間定位。
2025 年 7 月 2 日，海南大學/華中科技大學駱清銘院士、龔輝教授及加州大學洛杉磯分校董紅衛(wèi)教授團隊（豐釗為第一作者）合作，在國際頂尖學術(shù)期刊 Nature 上發(fā)表了題為：A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究論文。
該研究以 1 微米的各向同性分辨率繪制了小鼠三維腦區(qū)和立體定位圖譜，該圖譜可為大型腦圖譜項目提供數(shù)據(jù)分析和可視化支持，有望成為一種多功能腦科學工具，用于在單細胞水平上研究整個大腦。
在這項最新研究中，研究團隊通過連續(xù)微光學切片斷層成像技術(shù)，以各向同性 1 微米的分辨率呈現(xiàn)了一套基于尼氏染色的小鼠全腦細胞結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)集。
通過整合多模態(tài)圖像，研究團隊構(gòu)建了小鼠大腦三維參考圖譜--STAM，提供了 916 個結(jié)構(gòu)的三維形貌，并能夠生成任意角度的 1 微米分辨率切片圖像。研究團隊進一步開發(fā)了一個基于信息學的平臺，用于可視化和共享圖譜圖像，提供諸如腦切片配準、神經(jīng)元回路繪制和智能立體定向手術(shù)規(guī)劃等服務(wù)。該圖譜可與廣泛使用的立體定位圖譜兼容，支持在二維空間中對相應(yīng)冠狀面進行跨圖譜導航，并在三維空間中實現(xiàn)圖譜空間的跨圖譜空間映射。
通過為大型腦圖譜項目提供數(shù)據(jù)分析和可視化支持，該研究開發(fā)的 STAM 圖譜有望成為一種多功能的腦科學工具，用于在單細胞水平上研究整個大腦。
論文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8
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