多層結構的核仁是核糖體生物合成的主要場所,在這里,構成核糖體小亞基(SSU)和大亞基(LSU)的 rRNA 前體(pre-rRNA)依次成熟。然而,pre-rRNA 加工與核仁亞結構之間的空間功能關系,以及這種關系如何適應細胞生理需求的變化,一直未被完全理解。
2025 年 7 月 23 日,中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心陳玲玲研究員團隊(博士生潘宇航、博士后單琳、博士生張宇瑤為共同第一作者)在國際頂尖學術期刊 Nature 上加速上線了題為:Pre-rRNA spatial distribution and functional organisation of the nucleolus 的研究論文。
該研究系統(tǒng)解析了構成核糖體大小亞基的 rRNA 前體(pre-rRNA)在核仁中的動態(tài)成熟過程,發(fā)現(xiàn)了核糖體小亞基(SSU)pre-rRNA 的加工效率直接調控核仁內層結構的穩(wěn)定性,提出了 pre-rRNA 加工的區(qū)域化模型及其在多層結構核仁的功能與進化中具有重要意義。
真核細胞的細胞核中的核仁由多個不同的區(qū)室在三維空間中嵌套而成,從內向外依次包括:纖維中心(Fibrillar Center,F(xiàn)C)、致密纖維組分(Dense Fibrillar Component,DFC)、致密纖維組分外側區(qū)域(periphery of DFC,PDFC)和顆粒區(qū)(Granular Component,GC)。這些區(qū)室各司其職,協(xié)同完成核糖體前體 RNA (pre-rRNA)的轉錄、加工修飾及核糖體亞基的組裝等關鍵步驟,最終產生近乎成熟的核糖體大、小亞基。
在這項最新研究中,研究團隊通過時空分析揭示了人類核仁中核糖體亞基加工的區(qū)室特異性,小亞基加工體維持在纖維中心/致密纖維組分/致密纖維組分外側區(qū)域(FC/DFC/PDFC),而大亞基 pre-rRNA 主要轉移到致密纖維組分外側區(qū)域/顆粒區(qū)(PDFC/GC)。
增殖緩慢的細胞表現(xiàn)出出乎意料的以 5' 外轉錄區(qū)(5' ETS)為中心的核糖體小亞基(SSU)加工障礙,同時伴有 FC/DFC 結構重塑以及 SSU 輸出受阻。直接對 5' ETS 加工的干擾至少部分重現(xiàn)了這些 FC/DFC 的變化,這支持了 SSU 加工與核仁結構之間的功能相互依賴性。
值得注意的是,低等的無羊膜動物(例如斑馬魚)的雙層核仁(其纖維中心和致密纖維中心融合)表現(xiàn)出獨特的 5'ETS 分布,并且其 pre-rRNA 的流動速度比羊膜動物(例如哺乳動物)的多層核仁要慢。在雙層核仁中創(chuàng)建 FC/DFC 物理分界面可提升 pre-rRNA加工效率,說明嵌套式 FC/DFC 結構在進化中的形成可能優(yōu)化了此類生物大分子的加工效能。
總體而言,該研究描繪了核糖體前體 RNA(pre-rRNA)的時空分布,揭示了以 5'ETS 為中心的小亞基加工在維持核仁亞結構方面的重要作用,并表明了羊膜動物多層核仁結構可能具有的進化優(yōu)勢。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09412-1
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