細(xì)菌和古菌進(jìn)化出了多種多樣的防御機(jī)制來(lái)抵御病毒(噬菌體)的侵害。例如在細(xì)菌和古菌中廣泛存在的 CRISPR-Cas 系統(tǒng),對(duì)該系統(tǒng)的研究不僅揭示了基本的生物學(xué)過(guò)程,還帶來(lái)了革命性的新技術(shù),讓基因編輯、表達(dá)調(diào)控和 RNA 敲低成為可能。
許多最近發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌防御機(jī)制,尤其是那些與膜相關(guān)的防御機(jī)制,我們?nèi)灾跎伲?strong>Kiwa 系統(tǒng)就是其中一個(gè)例子。Kiwa 系統(tǒng)是已測(cè)序細(xì)菌基因組中 20 個(gè)最豐富的防御系統(tǒng)之一,這表明其防御譜廣泛且進(jìn)化成功。其由兩種蛋白成分組成:四通跨膜蛋白 KwaA 和 KwaB,然而,Kiwa 系統(tǒng)是如何感知噬菌體并提供保護(hù)的,目前仍不清楚。
2025 年 7 月 28 日,紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心張志瑩博士、南安普頓大學(xué)吳儀博士等作為共同第一作者,在國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊 Cell 上發(fā)表了題為:Kiwa is a membrane-embedded defence supercomplex activated at phage attachment sites 的研究論文。
該研究解析了細(xì)菌的一種跨膜防御機(jī)制--Kiwa 系統(tǒng),揭示了細(xì)菌如何在噬菌體附著瞬間,啟動(dòng)分子級(jí)別的防御圍欄來(lái)抑制噬菌體的復(fù)制。
細(xì)菌和古菌部署了多種抗病毒防御系統(tǒng),但其中許多防御系統(tǒng)的具體機(jī)制尚未得到闡明。
在這項(xiàng)最新研究中,研究團(tuán)隊(duì)對(duì) Kiwa 系統(tǒng)進(jìn)行了描述,這是一個(gè)分布廣泛的雙組分抗病毒防御系統(tǒng),由跨膜傳感器 KwaA 和 DNA 結(jié)合效應(yīng)子 KwaB 組成。
冷凍電鏡分析表明,四聚體 KwaA 與四組 KwaB 二聚體組裝成一個(gè)大的圍欄狀跨膜超級(jí)復(fù)合體。噬菌體結(jié)合后,KwaA 在膜上感知到感染,導(dǎo)致 KwaB 與被釋放的噬菌體 DNA 結(jié)合,并抑制其復(fù)制和后期轉(zhuǎn)錄,而不誘導(dǎo)宿主細(xì)胞死亡。盡管 KwaB 能夠獨(dú)立結(jié)合 DNA,但其抗病毒活性需要與 KwaA 結(jié)合,這表明存在空間或構(gòu)象上的調(diào)控。
研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步證明了,噬菌體編碼的 DNA 模擬蛋白 Gam 直接與 KwaB 結(jié)合并抑制其活性,但與 Gam 靶向的 RecBCD 系統(tǒng)共表達(dá)時(shí),Kiwa 系統(tǒng)的防御保護(hù)作用得以恢復(fù)。也就是說(shuō),同時(shí)存在 Kiwa 系統(tǒng)和 RecBCD 系統(tǒng)的細(xì)菌,難以被噬菌體同時(shí)突破防線,這也揭示了細(xì)菌不同防御系統(tǒng)之間發(fā)揮協(xié)同和互補(bǔ)作用。
該研究的核心發(fā)現(xiàn):
Kiwa 在噬菌體附著的膜位點(diǎn)被激活;
Kiwa 形成了由 KwaA 和 KwaB 構(gòu)成的跨膜超級(jí)復(fù)合物;
KwaB 與噬菌體 DNA 結(jié)合以阻止復(fù)制和后期轉(zhuǎn)錄;
噬菌體編碼的 DNA 模擬蛋白 Gam 抑制 Kiwa,但 RecBCD 保持防御功能。
總的來(lái)說(shuō),該研究表明,Kiwa 系統(tǒng)是一種不誘導(dǎo)宿主細(xì)胞死亡的膜激活防御機(jī)制,通過(guò)協(xié)調(diào)膜相關(guān)噬菌體感染檢測(cè)與下游效應(yīng)物的 DNA 結(jié)合,從而形成一種空間上協(xié)調(diào)一致的抗病毒機(jī)制。此外,這項(xiàng)研究還支持了這樣一種觀點(diǎn)--原核生物的免疫系統(tǒng)是一個(gè)相互關(guān)聯(lián)、多層次的網(wǎng)絡(luò),利用冗余性和多樣性來(lái)應(yīng)對(duì)快速進(jìn)化的噬菌體的威脅。這些發(fā)現(xiàn)為設(shè)計(jì)新型抗菌工具、合成生物學(xué)應(yīng)用及細(xì)胞器工程提供了寶貴的結(jié)構(gòu)模板。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00791-3
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