雙特異性抗體(bsAbs)簡直是生物界的 "雙面間諜",憑借一手 "左右開弓" 的結(jié)合絕技圈粉無數(shù)。它能同時盯上兩個抗原靶點,搞出 1+1>2 的協(xié)同效果,連傳統(tǒng)單特異性抗體組隊都得甘拜下風(fēng)。不過這位 "潛力股" 的成長之路可不順,設(shè)計構(gòu)建時總被各種麻煩絆住腳 -- 誰讓它的結(jié)構(gòu)復(fù)雜度比傳統(tǒng)抗體高出好幾個段位呢。這些麻煩五花八門:外源抗原結(jié)合域一融合,生物物理穩(wěn)定性就掉鏈子;抗體鏈還總愛 "錯點鴛鴦譜",結(jié)果生出些難以清除的 "雜質(zhì)寶寶"。想讓 bsAbs 既有預(yù)期的 "超能力",又具備優(yōu)秀的 "藥界潛質(zhì)",就得在設(shè)計時精打細算,再給它來一輪全方位的分子工程 "改造升級"。本文就來好好嘮嘮 bsAbs 設(shè)計里的那些關(guān)鍵考量,以及能高效打造不同分子形態(tài) bsAbs 的先進工程原理。
簡介
近年來,雙特異性抗體(bsAbs)在治療界可謂 "C 位出道",為靶向治療打開了一扇新大門。它有個獨門絕技 -- 能同時對兩個不同靶點 "下手",從而協(xié)同靶向疾病通路,這可是傳統(tǒng)免疫球蛋白組合想都不敢想的操作。雖說治療性 bsAbs 是人工工程的 "杰作",但在自然界也能偶爾撞見它們的身影,比如通過 IgG4 半分子的 Fab 臂交換形成的那種。
工程 bsAbs 的結(jié)合 "十八般武藝",讓人們對它在多種疾病中的應(yīng)用浮想聯(lián)翩,癌癥、自身免疫性疾病、傳染病都可能被它攻克。最近有篇文章更是把雙特異性和多特異性藥物封為 "療法新勢力"。bsAb 的治療潛力讓這個領(lǐng)域成了 "香餑餑",競爭那叫一個白熱化,但也催生出不少腦洞大開的工程奇跡,看看臨床階段 bsAb 五花八門的分子形態(tài)就知道了。
作用機制
bsAbs 的雙重結(jié)合能力,讓它的作用機制(MOA)比傳統(tǒng)單克隆抗體復(fù)雜得多,簡直像個精密的 "生物鐘表"。對很多 bsAbs 來說,想要發(fā)揮作用,兩個結(jié)合事件得在特定時間和空間 "約會"。也就是說,兩種結(jié)合特異性不僅得按特定物理排列 "站位"(比如把兩個靶標拉得近近的,誘導(dǎo)下游信號傳導(dǎo)),還得講究 "時機"(比如同時連接細胞,或者按順序靶向跨越屏障)。
有些 bsAbs 的作用機制,光靠兩個親本抗體 "組隊" 根本搞不定,這種就被稱為 "專性 bsAbs"。但就算沒有這種 "非它不可" 的機制,bsAbs 往往也不只是簡單的 "零件拼接",效力常常比親本抗體組合強得多。據(jù)推測,這可能是沾了親和力的 "光"。
雙重靶向還能提高靶標選擇性和定位精度,從而減少副作用,對于避免 "誤傷友軍"(也就是 "在靶、脫瘤" 效應(yīng))特別有用。就算 bsAb 的活性和親本抗體組合差不多,它在生產(chǎn)上也有優(yōu)勢 -- 畢竟只需要生產(chǎn)一個分子,省事兒多了。
BsAb 的雙靶向活性大致能分為 "順式" 和 "反式" 兩類。能不能把特定抗原結(jié)合域巧妙 "混搭",針對性地作用于相同(順式)或不同(反式)的細胞 / 分子靶點,直接決定了 BsAb 能不能發(fā)揮協(xié)同功能。
反式作用的 BsAbs 就像 "紅娘",專找不同的靶點 "牽線搭橋",形成物理連接。要是它結(jié)合的是不同細胞靶點,那作用機制就全靠把兩種細胞 "綁" 在一起,實現(xiàn)細胞間 "搭橋"。雙特異性 T 細胞銜接子就是個典型例子,它一邊勾搭腫瘤相關(guān)抗原,一邊聯(lián)系 CD3(一種超強共刺激受體),成功讓 T 細胞和腫瘤細胞 "見面"(圖 1A)。這貨還能繞過 T 細胞的自然活化流程,通過聚集低親和力 T 細胞受體,直接把 T 細胞 "騙" 到表達腫瘤相關(guān)抗原的細胞那兒去。
"非反式" 這個詞在分子層面也有用武之地,比如雙互補位抗 HER2 bsAb,它結(jié)合的是兩個不同的 HER2 分子(非反式),而不是同一個(順式)。這種交叉結(jié)合能把相鄰分子連起來,誘導(dǎo) HER2 發(fā)生不一樣的重組,還能引發(fā)補體依賴性細胞毒性,這可是單特異性抗 HER2 抗體組合做不到的。這種分子非反式結(jié)合,主要和那些靶向同一抗原上不同且不重疊表位的雙互補位 bsAb 有關(guān)。
順式作用的 bsAb 則像 "同小區(qū)保安",主要盯著同一細胞上的抗原(圖 1B、C)。能激活同一細胞表面兩個受體的激動劑 bsAb(細胞順式激活),可以通過精確控制受體亞基 "牽手" 來選擇性調(diào)控信號傳導(dǎo)。比如有個靶向白介素(IL)-2 受體亞基 IL-2Rβ 和 IL-2Rγ 的 bsAb,它能通過中等親和力的 IL-2Rβγ 增強信號傳導(dǎo),同時削弱高親和力 IL-2Rαβγ 的信號。還有個靶向死亡受體(DR)4 和 5 的雙重激動劑雙特異性 Surrobody,效力比親本抗體組合強,可能是因為它能讓 DR4 和 DR5 "抱團" 形成異二聚體。
另一種順式激活 bsAbs 被稱為 "輔因子模擬器",主要作用是幫酶和它的 "專屬底物" 找準位置(圖 1F)。凝血因子 FVIIIa 模擬物就是這么個角色,能促進 FIXa 和 FX "相遇"。這倆一旦 "組隊",就會生成活化因子 Xa(FXa),這可是凝血途徑的關(guān)鍵 "推手",所以這類 bsAb 和血友病 A 的治療關(guān)系密切。對于那些產(chǎn)生了抗 FVIII 同種抗體的患者來說,重組 FVIII 治療基本沒用,這種 bsAb 輔因子模擬物可就成了 "救星"。
圖 1. bsAb的特異性作用機制。(A)反式細胞橋接通過 bsAb 在不同細胞之間建立了物理連接。該機制尤其適用于 T 細胞重定向 bsAb,因為這種物理連接有助于靶向激活 T 細胞的細胞毒性。(B)受體的順式橋接引起激動劑交聯(lián),并激活相關(guān)的受體信號傳導(dǎo)。(C)順式拮抗作用阻斷受體結(jié)合,從而阻止信號通過受體復(fù)合物進行傳導(dǎo)。(D)搭載型 bsAb 利用一種特異性靶向受體,該受體有助于跨膜轉(zhuǎn)位到原本無法進入的區(qū)室,而另一種特異性則在此發(fā)揮其功能。閃電表示由抗體結(jié)合介導(dǎo)的活性。(E) BsAb可以發(fā)揮定位效應(yīng)。例如,激動劑 bsAb也具有腫瘤靶向特異性,通過將激動劑機制限制在腫瘤標志物存在的位點,限制了靶向、非腫瘤效應(yīng)。(F) BsAbs通過準確定位酶和底物充當輔助因子模擬物。
也可以用拮抗性 bsAb 來 "搗亂" 信號通路,它們會霸占細胞受體,不讓可溶性受體配體 "靠近"。這類拮抗性 bsAb 常被用來阻斷免疫檢查點受體,這可是抗癌免疫治療里的 "明星靶點"。比如雙重阻斷免疫檢查點通路,或者同時盯上免疫檢查點和抗腫瘤免疫的負調(diào)節(jié)因子(像與不良預(yù)后相關(guān)的 TGF-β)。
順式作用的拮抗性 bsAb 還能靶向相關(guān)或重疊的信號通路。所以這類 bsAb 可以一邊對付原發(fā)性癌癥相關(guān)通路,一邊處理那些可能因為原發(fā)通路被阻斷而 "冒頭" 的相關(guān)通路,從而阻止癌細胞 "逃之夭夭"。HER2xHER3 雙特異性抗體就是個例子,HER3 的上調(diào)可是 HER2 抑制劑耐藥的 "罪魁禍首"。
激動劑型 BsAbs 的發(fā)現(xiàn)可比拮抗性的難多了,畢竟抗體的激動活性受一堆難以捉摸的因素影響。比如有研究發(fā)現(xiàn),激動劑型抗 CD3 BsAbs 的細胞毒活性就和親和力、表位、分子幾何形狀脫不了干系。相比之下,有效的拮抗劑通常只要親和力高,能和天然配體 "搶位置" 阻斷其作用就行。另外,把 BsAbs 組合起來還能獲得治療效應(yīng)機制的額外協(xié)同效果,不過這可能會讓作用機制更復(fù)雜,給 BsAb 設(shè)計再添點 "麻煩"。
Fc 的作用
所有天然抗體都帶著個 "功能小助手"--Fc 區(qū),它對抗體的效應(yīng)功能至關(guān)重要,通過和同源 Fc 受體以及補體蛋白等可溶性免疫介質(zhì)結(jié)合,觸發(fā)宿主細胞反應(yīng)。對 Fc 蛋白和糖進行 "改造",能消除或大幅增強 Fc 介導(dǎo)的效應(yīng)功能,比如 NK 細胞的抗體依賴性細胞毒作用(ADCC)、巨噬細胞的抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP),甚至某些 CD8 T 細胞反應(yīng)。
人們在設(shè)計傳統(tǒng)單特異性抗體的 Fc 區(qū)上花了不少功夫,就是為了讓它具備天然同種型沒有的效應(yīng)功能(或者去掉某些功能)。比如給 IgG1 抗體加個 FcγR 沉默突變,就能造出效應(yīng)子減少的版本,但還保留著 IgG1 的優(yōu)良特性。反過來,搞搞糖工程,比如給 Fc-IgG1 N - 糖去掉核心巖藻糖,或者做點突變,能增強和某些 Fc受體的結(jié)合,從而提升效應(yīng)功能,像 FcγRIIIa 介導(dǎo)的 ADCC 或 ADCP。這些效應(yīng)調(diào)節(jié)突變或糖工程,通常和 bsAb 常見的突變(比如用于鏈轉(zhuǎn)向的突變)不沖突,所以在含 Fc 的 bsAb 里也能組合使用。
根據(jù)預(yù)期的藥理作用(MOA),有些 BsAb 可能更適合 "改造" Fc 區(qū),有些則完全不用動。臨床開發(fā)的 BsAb 大多都帶著 Fc 區(qū),畢竟這個結(jié)構(gòu)域能用 Protein A輕松純化,而且 FcRn 循環(huán)還能延長半衰期。含 Fc 區(qū)的 BsAb 根據(jù)分子幾何結(jié)構(gòu),大概能分成對稱型和非對稱型。
雖說 Fc 區(qū)改造技術(shù)挺成熟,但有時候,基于小片段的 bsAb 比大型 IgG 樣 bsAb 更有優(yōu)勢?;谄蔚?bsAb 通常是把獨立抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域通過基因融合 "拼" 出來的,也能用多聚化結(jié)構(gòu)域組裝。這種方法的好處是,產(chǎn)物通常個頭小,還沒有重要的糖基化位點,用細菌或酵母這類簡單表達系統(tǒng)就能高產(chǎn)。
基于片段的 BsAb 通常就一兩條多肽鏈,大大降低了因鏈錯配產(chǎn)生 "雜質(zhì)寶寶" 的風(fēng)險,這可是那些個頭大、結(jié)構(gòu)復(fù)雜的 BsAb 常遇到的頭疼事。而且,抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域通過簡單基因融合,在價態(tài)和特異性組合上特別靈活,比如能搞出 1+3 和 3+3 的 BsAb 形式。
傳統(tǒng)上,不含 Fc 區(qū)的基于片段的 bsAbs 多是用 scFv 片段做的,把它們以不同方式組合,能形成 BiTE、TandAb 或 DART 分子,這些都是 scFv 基片段 bsAbs 的主要類型(圖 2A)。不過 scFv 片段常有點 "小脾氣",熱力學(xué)不穩(wěn)定,還愛搞 VH-VL 錯配,結(jié)果生成不想要的自組裝產(chǎn)物。
scFv 的這些 "毛病" 讓人們把目光投向了單域抗體(sdAbs)。sdAbs 也是小個子(約 15 kDa)的抗原結(jié)合域,能通過基因融合形成基于片段的 bsAbs,而且它穩(wěn)定又結(jié)實,本質(zhì)上是單體,不容易發(fā)生不良自組裝。把 sdAbs 分別融合到 CH1 和 Cκ 上,不用接頭也能組合,借助恒定結(jié)構(gòu)域的自然配對作為二聚化基序,就能生成小的 Fab 樣 bsAbs。當然啦,抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的組合方式還有很多,遠不止上面說的這些。
基于片段的 bsAb 有個潛在 "短板"-- 個頭小又沒有 FcRn 結(jié)合區(qū),所以清除得快。不過在某些應(yīng)用和形式中,這個問題已經(jīng)得到解決,比如把 bsAb 和 HSA 偶聯(lián),或者加個抗 HSA 抗體片段。
圖 2 .根據(jù)分子結(jié)構(gòu)分類的最常見 bsAb形式的示意圖。(A)基于片段的 bsAb 是由不帶 Fc 結(jié)構(gòu)域的小抗原結(jié)合片段組合而成。其構(gòu)建單元通常是 scFv 片段或 sdAb。(B)對稱 Fc 結(jié)構(gòu) bsAb 由一到兩條多肽鏈表達,通常通過將額外的抗原結(jié)合片段融合到 IgG 骨架上來實現(xiàn)。(C)不對稱 Fc 結(jié)構(gòu) bsAb 由兩到四條多肽鏈組裝而成。不對稱 bsAb 需要采取措施避免鏈錯配。示意圖中的小"旋鈕"和"孔"用于一般性地表示需要使用鏈轉(zhuǎn)向技術(shù)來確保 HC:HC 異二聚化和/或正確的 HC:LC 配對的位置。
對稱雙特異性抗體
對稱型 bsAb 堪稱抗體界的 "標準款",外形酷似 IgG,嚴格遵循 HC2LC2 的結(jié)構(gòu)套路。但別以為它就此墨守成規(guī) -- 它偷偷融合了額外的外源結(jié)合域,搖身一變成為能同時瞄準兩個抗原的 "雙料選手"。
正因如此,這些 bsAb 大多是四價的 2+2 型雙特異性抗體(每種抗原各打兩槍),但若想升級火力,通過雙融合還能改造成六價的 2+4 型 bsAb。要說最常見的四價 2+2 型,那可就有不少成員了:scFv-IgG 融合體、DVD-Ig、串聯(lián) scFv-Fc、sdAb-IgG 融合體,還有 tetra-VH IgG(見圖 2),個個都是武林高手。
對稱型 bsAbs 的一大 "懶人福利" 就是組裝起來特別省心,只需表達一兩條不同的多肽鏈就行。這意味著跟那些需要共表達三到四條多肽鏈的非對稱 bsAbs 比起來,它在初始篩選時,質(zhì)粒轉(zhuǎn)染比例的優(yōu)化工作簡直是小巫見大巫。而且 HC2LC2 結(jié)構(gòu)還大大降低了抗體鏈組裝出錯的概率,純化方案自然也就簡單多了。反觀非對稱 bsAbs,常常得額外加幾道純化工序,才能清除那些因組裝失誤產(chǎn)生的 "不合格產(chǎn)品"。
不過,凡事有利有弊,HC2LC2 結(jié)構(gòu)也限制了價態(tài)的 "自由度",因為抗原結(jié)合域總是成對出現(xiàn)。這就讓它在某些特殊場合束手束腳,比如遇到需要單價靶向以防止不良交聯(lián)的抗原(像 CD3 這種),就只能望洋興嘆了。
在設(shè)計對稱型 bsAbs 時,選對外源抗原結(jié)合域可是個技術(shù)活。以前大家偏愛 scFv,畢竟它從常規(guī)抗體的 Fv 結(jié)構(gòu)域衍生出來很方便。但現(xiàn)在,小個子 sdAb 正憑借獨特優(yōu)勢異軍突起,成為炙手可熱的融合搭檔。它天生嬌小,還是單體,不像 scFv 那樣總愛搞 "小團體"-- 也就是不良自組裝和聚集,實在是省心不少。
通常會用 10-25 個氨基酸的甘氨酸 - 絲氨酸接頭來融合外源抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域,這家伙在水溶液里柔韌性和穩(wěn)定性都沒得說,堪稱 "最佳粘合劑"。其他 bsAb 構(gòu)建體則另辟蹊徑,選用源自天然抗體接頭區(qū)域的接頭,比如抗體鉸鏈區(qū),或者連接 Fv 和 CH1/Cκ 的柔性接頭。選對合適的接頭,對保證抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域的正確間距和展示效果至關(guān)重要。有研究發(fā)現(xiàn),接頭長度還會影響 DVD-Ig 分子的抗原結(jié)合能力和穩(wěn)定性,真是差之毫厘,謬以千里。
抗體的模塊化特性簡直是設(shè)計師的福音,外源抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域既可以融合在支架多肽鏈內(nèi)部,也能接在末端,這樣就能打造出結(jié)構(gòu)五花八門的 bsAbs,完全可以根據(jù)需求量身定制。雖然這些外源抗原結(jié)合片段通常會跟全長 IgG 分子結(jié)合,但它們也能直接與 Fc 結(jié)構(gòu)域融合,讓構(gòu)建體比全長 IgG 分子小巧玲瓏,同時還能保留 Fc 區(qū)的功能,可謂一舉兩得。
除了把獨立的抗原結(jié)合結(jié)構(gòu)域融合到 IgG 支架上,還有些別出心裁的策略用來開發(fā)對稱的 IgG 樣 bsAbs。比如四重 VH IgG,它通過把不同的結(jié)合特異性分配到 Fv 的每個可變域上(用獨立的 sdAb 替換 VH 和 VL)實現(xiàn)雙特異性。還有更絕的,把單個 Fab 域的 6 個互補決定區(qū)(CDR)在空間上分成 VH 互補位(CDRH1、CDRL2 和 CDRH3)和 VL 互補位(CDRL1、CDRH2 和 CDRL3),再把這些單獨的互補位組合起來,就形成了稱為 DutaFab 的單個雙特異性 Fab 域,真是把 "拆分重組" 玩得明明白白。
非對稱雙特異性抗體
非對稱 BsAb 的分子幾何結(jié)構(gòu),讓它的設(shè)計和生產(chǎn)難度比對稱 BsAb 高出不少,這主要是因為不同抗體鏈共表達時,很容易產(chǎn)生抗體相關(guān)雜質(zhì),就像一鍋粥里混進了沙子,讓人頭疼。盡管有這些實際難題,非對稱 BsAb 依舊在進入臨床開發(fā)的 BsAb 類型中占據(jù)主力位置,看來實力不容小覷。
非對稱 BsAb 的一大顯著優(yōu)勢是,它的分子幾何結(jié)構(gòu)跟 IgG 的天然結(jié)構(gòu)長得很像,這就讓它能充分利用 IgG 良好的類藥特性,相當于站在巨人的肩膀上。而且非對稱結(jié)構(gòu)讓價態(tài)擁有了高度靈活性,比如能形成單價特異性(1+1),這可是對稱 bsAbs 辦不到的 "獨門絕技"。另外,那些結(jié)構(gòu)跟 IgG 分子相似度高的非對稱 bsAbs,被認為能降低免疫原性風(fēng)險,這可是個大大的加分項。不過要說明的是,非對稱 bsAbs 也能形成偏離嚴格二價 Y 形 IgG 幾何形狀的結(jié)構(gòu),比如三價 2+1bsAbs,真是個靈活的多面手。
HC:HC 配對
非對稱雙特異性抗體(bsAb),最讓人頭疼的問題就是多肽鏈錯配,結(jié)果就是產(chǎn)生一堆產(chǎn)品相關(guān)雜質(zhì),簡直是生產(chǎn)路上的 "攔路虎"。許多非對稱雙特異性抗體都得靠兩種不同重鏈(HC)的異二聚化來發(fā)揮作用,所以大家對能促進 HC 異二聚化的 HC 轉(zhuǎn)向平臺格外關(guān)注,都盼著能找到解決問題的鑰匙。
目前已經(jīng)開發(fā)出不少 HC 轉(zhuǎn)向平臺,大多源自行業(yè)內(nèi)部,它們的工作原理是在 CH3 域中創(chuàng)建互補界面,而 CH3 域可是控制抗體結(jié)構(gòu)完整性的關(guān)鍵部位。不過,對結(jié)構(gòu)如此重要的 CH3 結(jié)構(gòu)域進行突變,常常也會影響 bsAb 的熱穩(wěn)定性,真是牽一發(fā)而動全身。
雖然這些 CH3 轉(zhuǎn)向平臺的詳細設(shè)計原理在其他地方已有透徹的研究,但值得注意的是,這些平臺都在努力引入結(jié)構(gòu)互補的突變,目的是讓 HC 更傾向于異二聚化,同時抑制 HC 同二聚體的形成,就像在給 HC"牽紅線",讓它們按指定對象結(jié)合。
其中,第一個被報道且應(yīng)用最廣泛的平臺是旋鈕入孔(KiH)。它的操作很有意思,在一個 HC 里安插一個大個頭的色氨酸,在另一個 HC 里配上空間互補的小個子殘基,就像鑰匙和鎖一樣嚴絲合縫。KiH 策略之所以被廣泛采用,一是因為它在抑制 HC 同型二聚體方面效果顯著(除了極少量的孔 - 孔同型二聚體),二是因為它的專利已經(jīng)過期,不用再為專利費發(fā)愁。這樣一來,KiH 就為構(gòu)建不對稱 bsAb 提供了一條相對輕松又免費的路,要知道在這個領(lǐng)域競爭激烈,還多由行業(yè)主導(dǎo),其他好幾個平臺都受專利保護著呢,想用上可不太容易。
在構(gòu)建用于異二聚化的 HC 時,得明白 HC 異二聚體的相對豐度其實是一種平衡狀態(tài),并非固定不變。這種平衡會受到多種因素影響,比如相對質(zhì)粒和表達水平,通常得通過優(yōu)化質(zhì)粒轉(zhuǎn)染率來控制。這事兒可能相當費時間,尤其是在表達許多不同的 bsAb 時,簡直是對耐心的極大考驗。
比如我們最近就報道了一種不對稱 IgG/sdAb-Fc 構(gòu)建體,調(diào)整 HC 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染率后,兩條 HC 鏈的表達才達到最均衡的狀態(tài),這說明兩條 HC 可不會乖乖地平等共表達,還得靠人為調(diào)節(jié)。其他研究也發(fā)現(xiàn),可變結(jié)構(gòu)域的性質(zhì)會影響 HC 異二聚化,真是一環(huán)扣一環(huán)。
CH1 結(jié)構(gòu)域在 IgG 分子的組裝和運輸中扮演著重要角色,這也解釋了為什么當 Fab 結(jié)構(gòu)域被 sdAbs 或 scFvs 等片段取代后,HC 的表達行為會發(fā)生變化。有趣的是,有人通過對高表達的 λ 鏈進行密碼子去優(yōu)化,來平衡表達量較低的 κ 鏈,居然還改進了異二聚 κλ bsAb 的組裝,實際上提高了目標 bsAb 的產(chǎn)量,這波操作真是讓人眼前一亮。
HC:LC 配對
在雙特異性抗體(bsAb)的世界里,HC 和 LC 的配對就像一場嚴格的相親大會。選擇擁有共同 LC 的 bsAb,就好比給相親雙方定了個共同的擇偶標準,能從源頭上消除錯配的尷尬。不過,要找到這樣的 "共同語言" 可沒那么容易,不僅耗時,還得在序列多樣性上做出讓步,這無疑給尋找既專一又深情(高親和力)的結(jié)合物增加了不少難度。
但話說回來,共同 LC 這種方法也不是全無好處。它只需表達三條多肽鏈,在可制造性上算是松了口氣,就像原本要準備三桌飯菜,現(xiàn)在兩桌就夠了,確實省心不少。同理,找到有共同 HC 的 bsAb 也能避免 HC 錯配的問題,算是另一種 "捷徑"。
其他方法則像是給 Fab 裝上了 "導(dǎo)航系統(tǒng)",通過合理設(shè)計讓它們別走錯路,防止在不同多肽鏈共表達時鬧 "烏龍"。比如 Crossmab、正交 Fab 界面、交換 CH1/CL 結(jié)構(gòu)域、給天然鏈間二硫鍵做 "工程改造",還有嫁接 IgE 衍生的異二聚化結(jié)構(gòu)域,這些操作都像是給抗體配對上了多重保險。
使用兩種不同的 HC 和 LC,能讓 VH 和 VL 結(jié)構(gòu)域自由 "談戀愛",在尋找靶向特異性 bsAb 時不受束縛,盡情展現(xiàn)多樣性??闪硪环矫?,4 條多肽鏈要想平衡共表達,簡直比讓四個性格迥異的人同時合拍地跳一支舞還難。這就需要在載體設(shè)計和生產(chǎn)克隆生成上多花心思,甚至還會給下游工藝帶來額外壓力,像是一場艱難的協(xié)調(diào)工作。
當然,也可以先讓每個抗體半單獨表達,之后再組裝成最終的 bsAb 構(gòu)建體,通過這種 "先分居后同居" 的方式得到正確的 HC:LC 配對。但這種策略就像在原本的生產(chǎn)流程中加了道 "中間商",不僅要額外克隆生成和生產(chǎn)兩個組件,還得處理鉸鏈二硫鍵的充分還原和氧化等棘手步驟,簡直是給自己找麻煩。
還有些策略更絕,把其中一個 Fab 臂換成單鏈 Fab(scFab)結(jié)構(gòu)域,讓 bsAb 只由 3 條多肽鏈組成。scFab 的柔性接頭就像個靈活的 "月老",能促進 VH/CH1和 VL/CL 的正確配對。有意思的是,有些 Fab 域像是專一的 "癡情種",天生就喜歡和同源的 HC:LC 配對;而另一些則是 "大眾情人",在 HC:LC 配對上顯得比較隨意。研究發(fā)現(xiàn),這種配對偏好主要由 CDR 決定,這些發(fā)現(xiàn)或許能幫我們在選擇兼容的 HC:LC 對或?qū)ふ页R?LC 時少走彎路。
要是想從根本上避免 HC:LC 錯配的問題,還有個簡單粗暴的方法:用 scFv 片段或 sdAb 等抗體片段替換一個或兩個 Fab,讓 bsAb 最多只帶一個 LC,這樣就從源頭上杜絕了錯配的可能,堪稱 "釜底抽薪"。
由于 bsAb 正確鏈配對太重要了,人們對高級分析和高效下游純化工藝的興趣也日益濃厚,畢竟得準確找出并清除那些 "錯配分子",還得給它們定量呢。
替代鏈轉(zhuǎn)向
除了上面說的組裝方法,人們還探索了一些更依賴化學(xué)處理的策略,算是 "化學(xué)媒人" 的功勞。比如表達一種 IgG 樣 bsAb,它由 4 條不同的多肽鏈組成,以單一構(gòu)建體的形式表達??贵w鏈之間通過連接子連接,這個連接子就像個 "指揮家",控制著鏈的組裝,而且在表達后還能被去掉。給 BsAb 鏈加上亮氨酸拉鏈也能控制它們的結(jié)合,全長 IgG 分子還能通過 SpyTag/SpyCatcher 系統(tǒng)或者點擊化學(xué) "牽手成功"。
分子幾何構(gòu)形
BsAb 可不僅僅是各個部分的簡單相加,選擇最佳的分子結(jié)構(gòu)就像給房子選戶型,是獲得所需功能的關(guān)鍵設(shè)計考量。這意味著由相同分子構(gòu)建塊組成(總氨基酸含量相同),只是分子幾何形狀不同的 BsAb,可能會表現(xiàn)出天差地別的活性。
雙重靶向通常是個復(fù)雜的活兒,因為 BsAb 的配置得同時考慮內(nèi)部和外部限制才能達到預(yù)期的治療效果。內(nèi)部限制是分子幾何形狀自身帶來的,比如結(jié)合域之間的空間位阻,就像兩個人站得太近會互相妨礙一樣。有研究檢查了一整套對稱的 sdAb-IgG bsAb,包括鏡像特異性,發(fā)現(xiàn)抗原結(jié)合域的結(jié)合親和力會受到分子幾何結(jié)構(gòu)導(dǎo)致的域間空間位阻影響,而且當 sdAb 與 LC 連接時,這種影響比與 HC連接時更明顯。不過,這種內(nèi)部限制可以通過結(jié)構(gòu)工程來緩解,比如延長連接子,增加分子內(nèi)的靈活性和靶標結(jié)合之間的距離,就像把兩個吵架的人拉開點距離。
外部限制則是由靶環(huán)境的空間組織造成的,BsAb 得擺出特定的 "姿勢" 才能實現(xiàn)所需的時空靶標結(jié)合。對于有細胞間活性的 BsAb 來說,這種外部限制尤為明顯,畢竟細胞表面受體的空間結(jié)構(gòu)本身就很復(fù)雜。比如,T 細胞活化所需的免疫突觸,就取決于 T 細胞抗原受體和肽 - MHC 配體的間距。既然通過 T 細胞重定向 BsAb 建立的人工免疫突觸和天然免疫突觸長得很像,那在設(shè)計這些 T 細胞重定向 BsAb 時,就得參考自然間距的限制,別搞 "非主流"。
再舉個例子,當 Fynomer(源自 Fyn 激酶 SH3 結(jié)構(gòu)域的小結(jié)合蛋白)連接在 N端而不是 C 端時,F(xiàn)ynomAbs 的細胞毒活性更高。這說明,通過調(diào)整分子幾何形狀來實現(xiàn)最佳的位間定位,效果可能出奇地好。如果短位點間距更有利,那基于小片段的配置或許是個不錯的選擇。同樣,合理設(shè)計分子結(jié)構(gòu)和抗原結(jié)合域的位點間距,還能影響作用機理。在 T 細胞結(jié)合 scFv-IgG bsAb 中就得到了證實,將 scFv C 末端融合到 LC 上獲得的較短位點間距,在體外和體內(nèi)都展現(xiàn)出了更優(yōu)異的抗腫瘤效果。而且,靶向 CD19 和 CD3 的基于片段的 DART 分子,比由相同結(jié)合域組成的串聯(lián) scFv 表現(xiàn)出更好的細胞裂解作用,看來 DART 分子更緊湊的 "身材" 有利于維持細胞間接觸。
受體空間組織的重要性,讓人們開始關(guān)注受體:抗體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)分析,希望能揭開有效抗體結(jié)合的秘密,從而設(shè)計出更棒的抗體療法。其實,位間距離不僅在細胞間靶向中很重要,對于兩個表位都在同一靶細胞上的 bsAb 也同樣關(guān)鍵。比如,雙位抗 HER2 bsAb 在非活性交聯(lián)構(gòu)象中有效捕獲 HER2 的能力,就很大程度上取決于分子幾何形狀,就像用合適的網(wǎng)才能網(wǎng)住特定的魚。
鑒于 bsAb 結(jié)構(gòu)的影響這么大,想知道哪種 bsAb 最有效,光分析親本單特異性抗體可不夠。所以,我們得努力開發(fā)功能性篩選策略,不僅要評估親本抗體的結(jié)合能力,還得篩選組合 bsAb 組,看看哪種分子結(jié)構(gòu)和抗原結(jié)合域的組合最搭。
而且,影響 bsAb 效力的不只是分子幾何形狀,還有特異性的相對方向。比如,把抗 HER2 scFv 與抗 PD1 IgG 支架融合,和反過來把抗 PD1 scFv 與抗 HER2IgG 融合相比,HER2 的結(jié)合率明顯降低,這說明 "誰站前面誰站后面" 影響還挺大?;谄蔚?bsAb 也有類似的情況,相對方向不同,效果可能就差遠了。
在 bsAb 的設(shè)計中,不僅要優(yōu)化分子構(gòu)型和價態(tài)來達到所需的作用機制(MOA),還得優(yōu)化不同抗原結(jié)合臂之間的相對結(jié)合親和力。這可能就需要評估各種親和力變體的組合,才能找到最佳搭配,就像調(diào)配雞尾酒,比例對了味道才好。
平衡結(jié)合親和力的重要性,讓人們對機制建模產(chǎn)生了興趣,希望通過它理解親和力相互作用,從而更科學(xué)地設(shè)計 BsAb。這種親和力調(diào)節(jié)對于靶向 CD3 和腫瘤相關(guān)抗原的 T 細胞結(jié)合 BsAb 來說尤其重要,而且相對結(jié)合親和力已經(jīng)被證明會影響療效和選擇性,可不能馬虎。
可開發(fā)性考慮
可開發(fā)性這檔子事,光讓雙特異性抗體(bsAbs)像神槍手一樣精準結(jié)合抗原還不夠,它還得具備一身 "好藥相"-- 比如表達量得像打了雞血一樣飆升,穩(wěn)定性得堪比老陳醋越放越香,別動不動就自己抱成一團(自交聯(lián)和聚集),溶解度也得給力不能掉鏈子。這些特質(zhì)合在一起,我們管它叫 "可開發(fā)性特征"。就像相親前得先看看照片篩一輪,藥物開發(fā)早期也得給 bsAbs 做個可開發(fā)性體檢,免得辛辛苦苦砸了錢,最后發(fā)現(xiàn)這貨根本成不了臨床候選的 "潛力股"。
現(xiàn)在大伙兒都在忙著搞計算機預(yù)測工具和高通量分析,想在早期就揪出那些 "先天不足" 的候選者。但問題是,這些方法大多是給傳統(tǒng)單克隆抗體制訂的 "體檢標準",用到 bsAbs 身上就得格外留神了 -- 畢竟給 bsAbs 搞工程改造時,很可能一不小心就捅出些意想不到的 "簍子"。比如說,我們最近就發(fā)現(xiàn),把單鏈抗體(sdAb)嫁接到 IgG 這個 "支架" 上,表達量和穩(wěn)定性立馬就變了臉,而且變得有多離譜,全看分子的 "身材比例"、單鏈抗體接在 IgG 的哪個 "部位",還有接上去的 "零件" 數(shù)量。這研究算是把話挑明了:分子的 "顏值即正義"(最佳幾何結(jié)構(gòu))有多重要,單鏈抗體的 "體質(zhì)" 可不能光看單個零件或者它 "爹媽"(親本抗體)怎么樣就下結(jié)論。
bsAbs 的 "造型設(shè)計" 可能引發(fā)的其他 "健康問題" 還不少,比如動不動就碎成幾段(碎片化)、特別愛扎堆(聚集傾向),還有工程改造出來的二硫鍵可能一言不合就 "鬧離婚"(還原)又 "復(fù)婚"(再氧化)。所以說,分子的 "身材" 在化學(xué)和生物物理穩(wěn)定性這兩塊,絕 對是設(shè)計時的重中之重。
不光如此,分子的 "穿搭風(fēng)格"(形式)還會影響 bsAbs 在體內(nèi)的 "保質(zhì)期"(藥代動力學(xué)),大伙兒也在想辦法搞出能預(yù)測這一點的體外檢測方法。但架不住 bsAbs 的 "穿搭" 實在太多樣了,各種形式和 "身材" 讓人眼花繚亂,以至于到現(xiàn)在都沒法給它們的可開發(fā)性畫個統(tǒng)一的 "標準像"。
雖然搞大規(guī)模的系統(tǒng)研究,說不定能總結(jié)出各種 "穿搭" 和 "身材" 的共同規(guī)律,但目前的做法通常是:要么在專利平臺的 "圈子里",通過組合庫高通量篩選或者多參數(shù)優(yōu)化,找出那些 "體質(zhì)" 不錯的 bsAbs;要么就是走 "捷徑"-- 把單個表達的抗體組分用生物偶聯(lián)的方式拼起來,不用費勁吧啦地逐個生產(chǎn),就能攢出一大堆 bsAbs 來篩選,這操作簡直是 "搭積木式" 高效。
要是想針對性改善 bsAbs 的 "體質(zhì)",就得對那些 "拖后腿" 的片段下功夫優(yōu)化。比如給片段 "強身健體",讓它更耐熱、更易溶、化學(xué)性質(zhì)更穩(wěn)定,也別老想著 "抱團取暖"。但關(guān)鍵是,優(yōu)化完之后還得把它放回完整的 bsAbs 里再測一遍,免得 "單個零件給力,組裝起來掉鏈子"。
對 "藥相" 的要求也能提前融入發(fā)現(xiàn)過程,比如在篩選的時候就給 "好藥相" 設(shè)點 "加分項"。
結(jié)論
雙特異性抗體(bsAbs)絕 對是治療界的 "潛力新星",在各種醫(yī)療場景里都憋著一股狠勁想大顯身手。但這貨能不能成,全看設(shè)計和構(gòu)建夠不夠給力 -- 既得讓它治病夠猛,又得讓它的理化性質(zhì)夠乖,這平衡可得拿捏準了。
就像前面說的,bsAbs 的 "戰(zhàn)斗力" 和 "表現(xiàn)分" 之間的關(guān)系錯綜復(fù)雜,全看它的 "結(jié)構(gòu)造型" 給不給力?,F(xiàn)在大伙兒都在使勁兒設(shè)計那種既能雙靶點 "開黑",又能滿足開發(fā)要求,甚至能超越傳統(tǒng)單特異性抗體的 bsAbs。
這篇文章掏心窩子分享的這些見解,就是想說明白 bsAbs 工程有多 "燒腦",也想強調(diào)一句:想讓它的治療潛力徹底爆發(fā),戰(zhàn)略設(shè)計這步棋必須走對。值得一提的是,我們深挖了工程策略和實際考量里的那些 "彎彎繞繞",就是想弄清楚高效 bsAbs 設(shè)計里藏著的那些 "坑" 和 "機遇"。把這些設(shè)計原則的復(fù)雜門道捋清楚了,就能給 bsAbs 作為多功能 "治療利器" 的持續(xù)進化添磚加瓦,也能給未來更牛的 bsAb 療法研究開發(fā)指條明路。
原文來源:A.V.Madsen, L.E.Pedersen, P.Kristensen, et al., Design and engineering of bispecific antibodies: insights and practical considerations. Front. Bioeng. Biotechnol., 2024.
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