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CPHI制藥在線 資訊 roger 藥物設計學之共價、非共價、共價可逆藥物,您知道多少?

藥物設計學之共價、非共價、共價可逆藥物,您知道多少?

作者:Roger  來源:CPHI制藥在線
  2023-12-20
化學藥物按照結(jié)合方式,可以分為共價藥物、非共價藥物、共價可逆藥物3個種類。共價藥物結(jié)合能力強,藥效作用強,但相應的毒副作用也強;非共價藥物結(jié)合能力一般比較弱,藥效作用時間短,但毒副作用相對比較輕;共價可逆藥物,處于兩者中間,相對而言是比較理想的一類藥物,但其類型較少?,F(xiàn)在就這些不同類型藥物的化學結(jié)構進行討論總結(jié)。

       化學藥物按照結(jié)合方式,可以分為共價藥物、非共價藥物、共價可逆藥物3個種類。共價藥物結(jié)合能力強,藥效作用強,但相應的毒副作用也強;非共價藥物結(jié)合能力一般比較弱,藥效作用時間短,但毒副作用相對比較輕;共價可逆藥物,處于兩者中間,相對而言是比較理想的一類藥物,但其類型較少?,F(xiàn)在就這些不同類型藥物的化學結(jié)構進行討論總結(jié)。

       1,共價藥物

       共價藥物主要是針對半胱氨酸、賴氨酸、絲氨酸等含有巰基、羥基等可形成共價鍵的親核氨基酸而設計的[1-2]。最為著名的共價藥物為阿司匹林、青霉素等(圖1)。大多數(shù)共價藥物的開發(fā)都包括有意引入可與靶標相互作用的共價鍵合部分。其中,丙烯酰胺部分是最常用的,環(huán)氧乙烷、乙烯磺酰胺等也是常見的集團。這些藥物分子上的親電基團可以與受體上廣泛存在的親核基團,諸如巰基、羥基、氨基和咪唑基等發(fā)生親電親核反應,產(chǎn)生共價鍵,從而更高地結(jié)合受體。

青霉素結(jié)構式

       圖1 青霉素結(jié)構式(圖片出自網(wǎng)絡)

       最近比較暢銷的共價藥物為伊布替尼。伊布替尼是一種抗腫瘤藥,通過抑制惡性B細胞的體內(nèi)增殖和存活以及體外細胞遷徙,從而抑制腫瘤生長。

伊布替尼結(jié)構式

       圖2 伊布替尼結(jié)構式(圖片出自網(wǎng)絡)

       2,非共價藥物

       非共價藥物是現(xiàn)今化學藥物最大的一個種類。比如伊馬替尼。非共價藥物一般不含有不飽和的丙烯酰胺等結(jié)構,不具備親電性能。傳統(tǒng)的藥物分子,大多數(shù)都是非共價藥物,它們與受體之間的作用力,通常為氫鍵、偶極偶極作用等非共價的作用。

伊馬替尼結(jié)構式

       圖3 伊馬替尼結(jié)構式(圖片出自網(wǎng)絡)

       新年初始, FDA 批準了禮來的吡妥布替尼Pirtobrutinib,用于治療復發(fā)或難治性套細胞淋巴瘤(MCL) 成年患者。Pirtobrutinib是第三代BTK抑制劑,也是第一款非共價型BTK抑制劑首 創(chuàng)新藥。

吡妥布替尼Pirtobrutinib結(jié)構式

       圖4 吡妥布替尼Pirtobrutinib結(jié)構式(圖片出自網(wǎng)絡)

       3,共價可逆藥物

       常見的共價可逆結(jié)構包括羰基、氰基、硼酸結(jié)構等。見圖5。

常見的共價可逆結(jié)構

       圖5 常見的共價可逆結(jié)構[2]

       α-氰基丙烯酰胺是最近報道的一種共價可逆結(jié)構,見圖6。該結(jié)構最早由Jack Taunton報道,通過用可逆共價抑制劑靶向布魯頓酪氨酸激酶中的非催化半胱氨酸,使用半胱氨酸反應性氰基丙烯酰胺親電試劑的反向取向,其生物化學停留時間從幾分鐘到7天。在體內(nèi)停留時間延長的反向氰基丙烯酰胺在從循環(huán)中清除后仍與蛋白結(jié)合超過18小時。反向氰基丙烯酰胺策略被進一步用于發(fā)現(xiàn)停留時間為幾天的成纖維細胞生長因子受體(FGFR)激酶抑制劑,證明了該方法的可推廣性。

氰基丙烯酰胺共價可逆結(jié)構

       圖6 α-氰基丙烯酰胺共價可逆結(jié)構[3]

       最近Reja R M等開發(fā)了新的可逆賴氨酸結(jié)合,其特征是新的二氮硼 烷產(chǎn)物和與先前已知的亞氨基硼酸鹽化學相比慢得多的解離動力學。將二氮雜硼酸形成彈頭RMR1結(jié)合到肽配體上,可以產(chǎn)生葡萄球菌分選酶的強效和長效可逆共價抑制劑。

新型二氮雜硼酸可逆共價抑制劑

       圖7 新型二氮雜硼酸可逆共價抑制劑[4]

       條件共價可逆抑制劑也是一種新的想法,人體是一個龐大的化學反應庫,每天發(fā)生著各種化學反應,一個共價的抑制劑,在人體的化學反應庫的作用下,達到可逆的效果,該設計思路是一種新的設計思路。該設計思路能夠設計共價型的化合物,并且在人體的化學環(huán)境下進行降解,類似于前藥的設計思路。

       參考文獻:

       [1]Kim H , Hwang Y S , Kim M , et al. Recent advances in the development of covalent inhibitors[J]. RSC Medicinal Chemistry, 2021, 12(7):1037-1045.

       [2]Faridoon, Ng R, Zhang G, et al. An update on the discovery and development of reversible covalent inhibitors[J]. Medicinal Chemistry Research, 2023: 1-24.

       [3]J Michael Bradshaw , Jesse M McFarland , Ville O Paavilainen , Angelina Bisconte , Danny Tam , Vernon T Phan , Sergei Romanov , David Finkle , Jin Shu , Vaishali Patel , Tony Ton , Xiaoyan Li , David G Loughhead , Philip A Nunn , Dane E Karr , Mary E Gerritsen , Jens Oliver Funk , Timothy D Owens , Erik Verner , Ken A Brameld , Ronald J Hill , David M Goldstein , Jack Taunton. Prolonged and tunable residence time using reversible covalent kinase inhibitors,Nature Chemical Biology,2015,11:525-331.

       [4]Reja R M, Wang W, Lyu Y, et al. Lysine-targeting reversible covalent inhibitors with long residence time[J]. Journal of the American Chemical Society, 2022, 144(3): 1152-1157.

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